香蕉是世界上最重要的作物之一。对栽培香蕉的需求持续增长;然而，它们的生产受到生物和非生物复杂胁迫的极大影响。例如，香蕉产量受到枯萎病的严重威胁，这是由真菌镰刀菌引起的。
因此，培育具有改良性状的香蕉新品种，特别是对多种病原菌具有遗传抗性的新品种，对未来的香蕉生产至关重要;而高质量的香蕉基因组无疑会促进这种基因操作。
卡文迪什型香蕉(Cavendish-type banana)是一种起源于单特异性Musa acuminata (AAA)的香蕉，约占全球香蕉产量的一半，因此对人类社会具有重要意义。然而，到目前为止，香蕉品种的高质量单倍型参考基因组仍未解码。本研究报道了“巴西椒”(Cavendish)的端粒到端粒(T2T)和单倍型分辨参考基因组。
这个参考基因组由3个单倍体组成，大小分别为477.16 Mb、477.18 Mb和469.57 Mb。基因组质量评估公司确认了基因组的完整性(LAI分别为19.84、20.65和20.22)和BUSCOs分别为97.40%、97.80%和93.80%)。在三个单倍体组合中，分别鉴定出19、17和17个端粒。重复区分别为256.48 Mb(53.76%)、258.29 Mb(54.14%)和258.84 Mb(55.13%)。
此外，从每个组装中分别预测了37,185、37,241和37,178个高置信度的蛋白质编码基因。三个单倍体虽然同源，但差异很大，序列共线性较低。在1号、4号和7号染色体中发现了几个大的反向易位。
结果表明，影响果实品质和香气的基因家族扩展，如蔗糖/双糖/低聚糖分解代谢过程、蔗糖代谢过程、淀粉代谢过程和芳香化合物生物合成过程。此外，与花药和花粉发育相关的基因家族扩大，这可能与卡文迪什品种的孤雌性和不育性有关。
最后，在'八西椒'中鉴定出的抗性基因比在M. acuminata中少得多，特别是在染色体3和10上的基因簇，为香蕉抗病分子分析提供了潜在的靶点。该T2T单倍型分辨参考基因组为香蕉生物学研究、分子育种和遗传改良提供了宝贵的遗传资源。
《端粒-端粒单倍型解析参考基因组揭示三倍体卡文迪什香蕉亚基因组分化和抗病能力》一文发表在《园艺研究》杂志上。
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希望本篇文章《首个香蕉三倍体端粒-端粒单倍型解析的参考基因组》能对你有所帮助！
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